El Herbario Luis Fournier Origgi fue iniciado por el profesor José María Orozco Casorla en 1931, siendo en ese entonces parte de la Escuela Nacional de Agricultura, la cual a su vez pasó a formar parte de la recién fundada Universidad de Costa Rica en 1940. Entre los años 1956 y 2020 fue parte de la Escuela de Biología, y en ese último año fue transferido al Centro de Investigación en Biodiversidad y Ecología Tropical (CIBET).
El herbario tiene el acrónimo oficial USJ, y es el segundo más grande en el país. Incluye colecciones de plantas vasculares, briófitos, hongos, algas y mixomicetes (principalmente de Costa Rica), que en conjunto suman más de 112.000 especímenes y constituyen un importante recurso para la investigación sobre la biología de estos grupos de organismos. La mayoría de los especímenes se preservan secos, pero algunos se preservan en líquido.