General:
- Generar, articular y sistematizar el conocimiento científico sobre biodiversidad y ecología tropical, con énfasis en ecosistemas continentales a nivel institucional, nacional y regional, por medio de la difusión y la divulgación.
Específicos:
- Generar y divulgar información sobre la ecología, sistemática y evolución de la biodiversidad en todos sus niveles (genético, especies, comunidades y ecosistemas) de Costa Rica y de la región centroamericana.
- Generar y divulgar información sobre la distribución de la biodiversidad, sus posibles usos y las amenazas de conservación que enfrenta.
- Generar y mantener actualizadas las listas de especies (patrimonio natural) de diferentes grupos taxonómicos con las que cuenta el país, así como sugerir cambios a las listas de especies amenazadas, vedadas, entre otras.
- Mantener, ampliar y fortalecer las colecciones biológicas bajo custodia del Centro, así como sus respectivas bases de datos.
- Promover el conocimiento de la sociedad civil acerca de la biodiversidad y sus servicios ambientales y fortalecer la acción social desarrollada por la Universidad en temas relacionados con el patrimonio natural del país y la región centroamericana.
- Servir de vínculo que facilite el desarrollo de investigación ligada a estudios de grado y posgrado y así impulsar la relación entre la docencia e investigación.
- Fomentar la creación de redes de investigación, nacionales e internacionales, en las líneas desarrolladas por el Centro.
- Generar el conocimiento científico necesario sobre problemas ecológicos emergentes de interés nacional y promover estrategias de uso sustentable, conservación, gestión y restauración de la biodiversidad en el país y la región.
- Colaborar con otras unidades de la Universidad y entidades gubernamentales y no gubernamentales a nivel nacional e internacional que generan información sobre biodiversidad y ecología.